Chockvågsbehandling kan ha vissa biverkningar. Stötvågsterapi använder vanligtvis starka luftvågor för att uppnå terapeutiska effekter. Under behandlingsprocessen kan det leda till njurskador, sekundära ureterstenar och ureteral dilatation. Vissa patienter kan också uppleva lokal rodnad i vävnaden, subkutan blödning, blåmärken, smärta och andra symtom. Men de allra flesta fall är övergående och kommer gradvis att förbättras efter 1-2 dagars behandling. Det rekommenderas att patienter inte oroar sig för mycket, följer läkarens anvisningar, får snabb behandling och kontrollerar sitt tillstånd.